Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTPAP49638 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TTPAP49638 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTPAP49638 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TTPAP49638 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTPAP49638 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTPAP49638 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms