Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCT3P49368 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCT3P49368 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCT3P49368 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCT3P49368 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCT3P49368 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCT3P49368 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCT3P49368 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCT3P49368 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCT3P49368 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCT3P49368 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCT3P49368 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCT3P49368 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCT3P49368 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCT3P49368 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCT3P49368 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCT3P49368 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCT3P49368 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCT3P49368 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCT3P49368 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCT3P49368 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCT3P49368 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCT3P49368 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCT3P49368 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCT3P49368 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCT3P49368 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCT3P49368 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCT3P49368 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCT3P49368 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms