Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms