Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ME1P48163 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms