Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms