Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PGM1P36871 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGM1P36871 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGM1P36871 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGM1P36871 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGM1P36871 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms