Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GJA4P35212 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GJA4P35212 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GJA4P35212 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms