Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms