Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHA3P29320 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPHA3P29320 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms