Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD38P28907 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD38P28907 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD38P28907 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD38P28907 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD38P28907 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD38P28907 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD38P28907 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD38P28907 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD38P28907 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD38P28907 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD38P28907 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms