Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRMP28827 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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