Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLD1P28340 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms