Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NFKBIAP25963 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms