Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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