Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPREP23469 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPREP23469 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPREP23469 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPREP23469 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPREP23469 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPREP23469 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPREP23469 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPREP23469 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPREP23469 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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