Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms