Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYT1P21579 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYT1P21579 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms