Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms