Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms