Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTLA4P16410 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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