Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HPGDP15428 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HPGDP15428 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HPGDP15428 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HPGDP15428 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HPGDP15428 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HPGDP15428 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HPGDP15428 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HPGDP15428 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HPGDP15428 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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HPGDP15428 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HPGDP15428 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HPGDP15428 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HPGDP15428 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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HPGDP15428 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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HPGDP15428 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HPGDP15428 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HPGDP15428 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HPGDP15428 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HPGDP15428 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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