Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms