Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CEACAM1P13688 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEACAM1P13688 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEACAM1P13688 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEACAM1P13688 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEACAM1P13688 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEACAM1P13688 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEACAM1P13688 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEACAM1P13688 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms