Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms