Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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