Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX6O95503 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CBX6O95503 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CBX6O95503 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CBX6O95503 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CBX6O95503 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBX6O95503 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX6O95503 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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