Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CLDN9O95484 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CLDN9O95484 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CLDN9O95484 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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CLDN9O95484 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CLDN9O95484 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CLDN9O95484 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CLDN9O95484 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN9O95484 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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