Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms