Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCN2BO60939 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms