Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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PRAMEF10O60809 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PRAMEF10O60809 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PRAMEF10O60809 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PRAMEF10O60809 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PRAMEF10O60809 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PRAMEF10O60809 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PRAMEF10O60809 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PRAMEF10O60809 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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