Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBDO15205 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms