Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCC2H7BZ55 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCC2H7BZ55 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCC2H7BZ55 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCC2H7BZ55 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCC2H7BZ55 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCC2H7BZ55 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCC2H7BZ55 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCC2H7BZ55 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCC2H7BZ55 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCC2H7BZ55 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCC2H7BZ55 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCC2H7BZ55 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCC2H7BZ55 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCC2H7BZ55 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CROCC2H7BZ55 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CROCC2H7BZ55 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms