Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVV-1B6SEH8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms