Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms