Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms