Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9Y3F1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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