Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms