Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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USP18Q9UMW8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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