Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00474Q9P2X8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms