Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC10Q9NYD6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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