Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms