Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COMMD5Q9GZQ3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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