Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms