Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms