Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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