Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BPIFA3Q9BQP9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPIFA3Q9BQP9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms