Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCNS3Q9BQ31 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms