Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LGMNQ99538 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LGMNQ99538 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms