Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRIQ1Q96JM4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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