Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms